根据新加坡所得税法（Income Tax Act）第13A条和13F条的规定，运营新加坡注册船舶和外国船舶的航运公司可以享受新加坡某些航运收入的免税待遇。
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有关航运公司，合格企业，船舶管理服务等的定义，请参阅新加坡所得税法第13A（16）条。
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新加坡注册的船舶
运营新加坡注册船舶的国际航运公司可以享受以下的免税待遇：
1. 运送旅客、邮件、牲畜或货物
2. 拖拽或打捞作业
3. 船舶的租赁
4. 用于挖泥或开采海底天然气或石油活动的地震船或船舶
5. 外汇和风险管理活动，这些活动必须与公司的运营密切相关
6. 向经营或拥有新加坡船舶的公司提供的船舶管理服务（2010年2月22日起生效）
7. 集装箱的挪动、稳固、租赁等活动（2015年2月24日起生效）
8. 勘探或开采海上能源（2016年3月25日起生效）
9. 勘探或开采海上矿物（2016年3月25日起生效）
10. 任何对第8和第9条的辅助和支持活动（2016年3月25日起生效）
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外国船舶
对于外国船舶，免税条款只适用于在新加坡提货的收入。然而，税务豁免不包括由新加坡转运或在新加坡港口范围内的运输费用和运费。
a根据第13A条申请免税
符合免税资格的航运公司无需向新加坡税务局申请免税，只需在申报年度所得税和税款计算表时报告收入的数额和性质即可。
b根据第13F条下的国际航运利润
根据新加坡所得税法第13F条的规定，在国际海域运营的经批准的国际航运公司可以享有对某些航运收入的免税待遇。
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特许的国际航运公司是由新加坡海事和港务管理局（Maritime and Port Authority of Singapore, MPA）管理的“海运海事优惠计划-国际海运企业荣誉”（Maritime Sector Incentive – Approved International Shipping Enterprise Award, MSI-ASI）批准的公司。
具体详情，请参阅MPA官方网站www.mpa.gov.sg
经批准的国际航运企业可享受以下收入的免税：
1. 运送旅客、邮件、牲畜或货物
2. 将船舶包租予任何人，并且此人只在新加坡港口以外的海域运送游客、邮件、牲畜或货物
3. 以转运为目的的运送旅客、邮件、牲畜或货物的外国船舶
4. 外国船舶的拖拽或打捞作业
5. 将船舶包租予任何人，并且此人只进行拖拽或打捞作业
6. 用于挖泥或开采海底天然气或石油活动的地震船或船舶
7. 挖泥船或开采石油或天然气活动的地震船或船舶的租赁
8. 与上述业务有关的外汇和风险管理活动
9. 向经营或拥有任何特别目的的船舶的公司提供的船舶管理服务（2010年2月22日起生效）
10. 集装箱的挪动、稳固、租赁等活动（2015年2月24日起生效）
11. 勘探或开采海上能源（2016年3月25日起生效）
12. 勘探或开采海上矿物（2016年3月25日起生效）
13. 任何对第8和第9条的辅助和支持活动（2016年3月25日起生效）
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船舶处理的特许权和豁免权
根据2012年财政预算案所公布的海事业奖励计划（Maritime Sector Incentive），2011年6月1日及以后，符合条件的船舶经营人和出租人可享受对船舶处置收益的免税待遇。这是为了使新加坡的税收制度与其他国家的海运税收保持一致，并为海运行业提供稳定性和确定性。然而，此豁免条款不包括从事船舶交易业务的公司的船舶出售收益。
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税务计算和准备指南
1. 公司必须为其拥有的每艘新加坡船舶和外国船舶单独记录和准备经营账目，以便能够分别确定每艘船舶的收入和直接费用。
2. 公司应为每艘船舶保留证书，如税务局有要求，需立即提交给税务局检阅
a. 对于第13A条下的税务豁免，公司应保存每艘船舶的新加坡注册证书（Certificate of Singapore Registry）的副本
b. 对于第13F条下的税务豁免，公司应保存外国注册证书的副本
3. 要求税务豁免的公司必须确保符合MPA规定的条款和条件。
4. 公司应确保税收计算可以明确区分激励性收入的不同类别，并根据收入来源指出相关的所得税法规或激励计划。
5. 在获得免税和非免税收入的情况下，公司应当在合理的基础上分配每艘船舶不能直接识别的常见费 用（通常是指行政费用）。
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申请资本减免
（Capital Allowances）
如果海运公司获得免税和非免税收入， 应当按照营业额计算出常用固定资产的资本减免额。
如果固定资产可以直接确认为特定的免税或非免税收入来源，则这些资产的资本减免将从各自的收入来源中扣除。
例如，在国际海域运行的新加坡注册的船舶只能对第13A条中规定的航运收入申请资本减免。
根据第13A条，航运公司可以选择要求不享有部分免税收入的资本减免。但是根据第13F条的规定，航运公司必须为其免税航运收入申请资本减免。
如果航运公司根据第13A条为现在的财政年度申请免税收入的资本减免，未用余额（如果有）不能用来抵消任何其他收入或结转。
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