国家传染病中心设有门诊服务，门诊病患从踏入一楼的诊室起，就会由护士筛检分成两个源流。普通病患与有传染风险的病患在完全隔离的两个区域就诊。
诊室设有专门的X光室、抽血室和药房等设施，普通病患在诊室一站式完成检查、就诊、付款和拿药的流程后，从专门通道离开，减低传染的可能。
有传染风险的病人则进入特别隔离区，按传染途径分成呼吸性与接触性源流就医。需住院的病人，则通过专门走道与病人专用电梯转至病房。
记者走访发现，诊所的唯一入口处是公众最容易与传染病人有直接接触的区域。
国家传染病中心主任梁玉心解释，入口处专门设计成宽阔的流动空气区，病人传染给公众的概率很小。
在旧传染病中心工作了15年的高级护士长陈静（36岁）说，搬来新中心后，工作效率提高了，工作环境也更安全。
“以前给有传染风险的病患照X光，不是要带病人到另一个地方，就是要找移动式X光机就地检查，现在一站式服务，效率大大提高。新设施也给予前线医护人员更多安全保障，例如现在我们休息区与病房区的空调系统就完全隔开。”
国家传染病中心目前已有三分之一的设施投入运作。待今年5月全面启用后，中心将成为本地的传染病医疗枢纽。